Հայ Եկեղեցու աշխատանքն առավել կենտրոնացված դարձնելու համար նա վերափոխեց ՀԱԵ-ի թեմական կառույցը.

1999 թվականի հունիսի 29-ին Վաղարշապատում մահացել է Գարեգին Ա-ն (Նշան Հակոբի Սարգսյան) – 1995-1999 թվականներին Ամենայն Հայոց Կաթողիկոս 131-րդ։ 

1983-1994 թվականներին եղել է Մեծն Տանն Կիլիկիո կաթողիկոս Գարեգին Բ.
Հայ Եկեղեցու աշխատանքն առավել կենտրոնացված դարձնելու համար նա վերափոխեց ՀԱԵ-ի թեմական կառույցը.
  1996 թվականին նախկին 4 հայկական թեմի փոխարեն ստեղծվել է 8 թեմ, ստեղծվել են Ուկրաինայի և Հարավային Ռուսաստանի թեմերը։
  1997 թվականի սեպտեմբերին 80 տարվա ընդմիջումից հետո վերաբացվեց Գևորգյան ճեմարանի հիմնովին վերականգնված շենքը և սկսվեց ուսանողների համար նոր հանրակացարանի շինարարությունը։
Հայաստանում քրիստոնեությունը պետական կրոն հռչակելու 1700-ամյակի տոնակատարության շրջանակներում Վեհափառ Հայրապետը 1997 թվականի ապրիլի 7-ին դրեց Երևանի Սուրբ Գրիգոր Լուսավորիչ Մայր եկեղեցու առաջին քարը։

29 июня 1999 года в Вагаршапате- скончался  Гарегин I (Ншан Акоби Саргсян)- в 1995-1999 годах 131-й Католикос Всех Армян. С 1983- 1994 годы  был Католикосом Великого Дома Килликийского как Гарегин II.
Стремясь сделать работу Армянской церкви более целенаправленной, он преобразовал епархиальное устройство ААЦ
В 1996 году вместо прежних 4-х Армянских епархий было создано 8 епархий, а также учреждены Украинская и Южно-Российская епархии.
В сентябре 1997 года после 80-летнего перерыва вновь открылось капитально отреставрированное здание Геворкянской семинарии, началось строительство нового общежития для студентов.
В рамках празднования 1700-летия провозглашения христианства государственной религией в Армении Его Святейшеством Патриархом 7 апреля 1997 года в Ереване  был заложен первый камень Матери-Церкви Святого Григория Просветителя.

On June 29, 1999, Garegin I (Nshan Hakobi Sargsyan) died in Vagharshapat – in 1995-1999, the 131st Catholicos of All Armenians.  From 1983-1994 he was Catholicos of the Great House of Killikia as Karekin II.
In an effort to make the work of the Armenian Church more focused, he transformed the diocesan structure of the AAC
  In 1996, instead of the previous 4 Armenian dioceses, 8 dioceses were created, and the Ukrainian and South Russian dioceses were established.
  In September 1997, after an 80-year break, the thoroughly restored building of the Gevorkian Seminary reopened, and construction of a new dormitory for students began.
As part of the celebration of the 1700th anniversary of the proclamation of Christianity as the state religion in Armenia, His Holiness the Patriarch laid the first stone of the Mother Church of St. Gregory the Illuminator in Yerevan on April 7, 1997.